Die Fächerstruktur ist eine Besonderheit des Gymnasiums - keine andere Schulart bildet die Welt in solch systematischer Breite im Schulalltag ab. Die Vielfalt der Fächer spiegelt sich daher auch in der Verbandsstruktur wider: in den Fachgruppen und in ihrem Zusammenschluss, dem Bildungsbeirat des Bayerischen Philologenverbandes. Ergänzt werden die Fachgruppen durch wichtige Sachgebiete wie die Hochschuldidaktik sowie die Schulpsychologie und Beratung.